随着种植管理水平的提高，微生物菌剂、微生物肥料的使用越来越受到专业种植户的重视，微生物类产品在植物营养转化和吸收的过程中确实扮演者重要的角色，但是想要达到理想的效果，并不是撒进去或埋下去那么简单，还要掌握科学的使用方法才行。
微生物菌剂使用的要点：
1、要增施有机质。有机质是微生物生存和繁殖的必要的物质条件，土壤有机质含量低，微生物菌剂施用后很难在土壤中存活或繁殖，就谈不上微生物在土壤营养转化的过程中发挥作用；
2、微生物菌剂的使用要和杀菌剂的使用错开，保留一定的安全间隔期。常见的微生物菌剂大多是芽孢类微生物，属于细菌，另外还有一些真菌和放线菌类微生物在农业上使用，这些微生物的使用要避开杀菌剂（广谱性杀菌剂或无机铜杀菌剂影响明显），更不能和杀菌剂类产品混用；
3、科学施肥，不可过量使用化肥。化肥在土壤溶液中转化为盐离子，过量的化肥使用导致土壤中盐离子浓度过高，也会影响微生物菌剂的活性；
4、改良土壤，提高土壤的透气性和保水能力。微生物菌剂在土壤中的存活和繁殖，需要土壤具有良好的透气保水性能，板结土壤和过干、过湿的土壤都不利于微生物菌剂的功能发挥；
5、防治土壤酸化。酸化严重的土壤，也影响土壤微生物的活性和功能发挥。
